|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Новые методы экспресс-диагностики заразного узелкового дерматита крупного рогатого скота
УДК 619:616.98:578.828.11:636.2 Оригинальное эмпирическое исследование
Шевченко А. А., Коновалов М. Г. Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение Аннотация. В статье проведен сравнительный анализ эффективности двух запатентованных в Российской Федерации методов экс-пресс-диагностики заразного узелкового дерматита крупного рогатого скота: иммунохроматографического анализа (ИХА) и полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (ПЦР-РВ). Дополнительно представлены результаты оптимизации собственной ПЦР-РВ тест-системы на основе гена GPCR. Исследовано 286 проб патологического материала от животных с подозрением на заразный узелковый дерматит крупного рогатого скота в хозяйствах Краснодарского края, Республики Дагестан и Ставропольского края в период с 2022 по 2024 гг. Показано, что ИХА обеспечивает получение результата за 10-15 минут и пригоден для скрининга в полевых условиях (чувствительность 79-90%), однако уступает ПЦР-РВ по чувствительности. Разработанная ПЦР-РВ тест-система (праймеры LSDV-F/R, зонд LSDV-P) продемонстрировала предел обнаружения 10? копий ДНК/мкл, диагностическую чувствительность 99,2% (95% ДИ 97,5–100) и специфичность 99,5% (95% ДИ 98,1-100). Внутрилабораторная воспроизводимость (коэффициент вариации Ct) не превышала 3,5%, время анализа – 3 часа. Обоснована целесообразность комбинированного использования методов: ИХА – для первичного скрининга, ПЦР-РВ – для подтверждающей диагностики и выявления вирусоносителей на ранних стадиях инфекции. Ключевые слова: заразный узелковый дерматит, крупный рогатый скот, экспресс-диагностика, иммунохроматографический анализ, ПЦР в реальном времени. беспечение населения Российской Федерации безопасными и качественными продуктами животноводства является приоритетной задачей агропромышленного комплекса. В последние годы отечественное животноводство демонстрирует устойчивое развитие, однако инфекционные заболевания, среди которых наиболее опасны вирусные и бактериальные инфекции, наносят значительный экономический ущерб вследствие гибели животных, снижения продуктивности и затрат на проведение лечебно-профилактических мероприятий [1, 2]. Впервые заразный узелковый дерматит у крупного рогатого скота был установлен в Российской Федерации в 2015 году в Республике Дагестан, а в 2016 году заболевание было обнаружено в Краснодарском крае [3]. Заразный узелковый (нодулярный) дерматит относится к категории трансграничных вирусных инфекций, клинически проявляющихся кратковременной лихорадкой, образованием узелков (нодул) на коже, слизистых оболочках и в лимфатических узлах [4, 5]. Нодулярный дерматит причиняет значительный экономический ущерб: снижаются удои, отмечается потеря массы тела, у стельных коров происходят аборты, у быков-производителей развивается временное или постоянное бесплодие [6, 7, 8, 19]. Ключевым элементом системы противоэпизоотических мероприятий является своевременная и достоверная диагностика. Согласно данным Всемирной организации охраны здоровья животных (МЭБ), случаи заразного узелкового дерматита крупного рогатого скота подлежат обязательному уведомлению, а скорость принятия противоэпизоотических мер напрямую зависит от оперативности лабораторного подтверждения [9]. В современной ветеринарной практике доминируют два подхода: детекция антигенов возбудителя (иммунохимические методы) и выявление генетического материала (молекулярно-генетические методы) [10, 11]. В Российской Федерации разработаны и запатентованы эффективные диагностические средства, однако отсутствуют системные сравнительные исследования их эффективности на одном массиве клинического материала. Целью исследований являлась сравнительная характеристика двух запатентованных методов – иммунохроматографиче-ского анализа и ПЦР в реальном времени, а также оптимизация ПЦР-диагностики на основе таргетирования гена GPCR для повышения чувствительности и специфичности выявления вируса нодулярного дерматита. Материалы и методы исследований. Экспериментальные лабораторные исследования проводили в отделе молекулярно-биологических исследований Кропоткинской краевой ветеринарной лаборатории, на кафедре микробиологии, эпизоотологии и вирусологии Кубанского госагроуниверситета имени И. Т. Тру-билина и в диагностических отделах ВИЭВ РАН в период с 2022 по 2024 гг. Исследованию подвергнуто 286 проб патологического материала, отобранного от крупного рогатого скота с подозрением на нодулярный дерматит и от клинически здоровых животных в хозяйствах Краснодарского края, Республики Дагестан и Ставропольского края. Виды проб: везикулярная жидкость (n=48), соско-бы и биоптаты кожи из области узелковых поражений (n=112), цельная кровь с ЭДТА (n=76), фрагменты селезенки и лимфатических узлов (n=50). Контрольные пробы (n=30) получены от здоровых животных из благополучных хозяйств. Контрольные пробы не входили в общее количество проб. Условия транспортировки материала для лабораторных исследований и сроки его хранения были строго соблюдены согласно требований Решения Совета Евразийской экономической комиссии от 10 ноября 2017 года № 80 «Об утверждении Правил организации проведения лабораторных исследований (испытаний) при осуществлении ветеринарного контроля (надзора)». Иммунохроматографический анализ проводили согласно протоколу, описанному в патенте № 2648773 «Способ экспресс-диа-гностики нодулярного дерматита КРС» [12]. Использовали тест-по-лоски с иммобилизованными моноклональными антителами к рекомбинантному белку P32 вируса LSDV. Результат оценивали визуально через 10-15 минут. Положительным считали появление двух полос (контрольной и тест-линии). Выделение ДНК проводили методом нуклеосорбции с использованием коммерческого набора «Проба-НК» (ООО «ДНК-технология», Россия) согласно инструкции производителя. Контроль качества выделения ДНК оценивали по наличию фрагмента гена бета-актина крупного рогатого скота (длина ампликона 224 п.н.). С использованием базы данных GenBank (номера доступа: AF409137, MN995838) сконструированы специфические праймеры и флуоресцентный зонд к консервативному участку гена GPCR (G-protein-coupled chemokine receptor-like protein) LSDV. Выбор гена GPCR обусловлен его вариабельностью, позволяющей в перспективе дифференцировать полевые изоляты от вакцинных штаммов [13, 14]. Последовательности олигонуклеотидов представлены в таблице 1. Таблица 1 Характеристика олигонуклеотидных праймеров и зонда для выявления ДНК LSDV
Специфичность праймеров проверена in silico (BLAST) и экспериментально на панели из 12 родственных вирусов (вирус оспы овец, вирус оспы коз, герпесвирус крупного рогатого скота 1-го типа, вирус парагриппа-3, вирус лейкоза крупного рогатого скота и другие) – перекрестных реакций не выявлено. Постановка ПЦР в реальном времени. ПЦР-РВ выполняли на приборе «Rotor-Gene 6000» (Corbett Research, Австралия). Реакционная смесь объемом 25 мкл содержала: 5?ПЦР-буфер – 5,0 мкл; MgCl2 (25 мМ) – 2,0 мкл; LSDV-F (10 пмоль) – 1,0 мкл; LSDV-R (10 пмоль) – 1,0 мкл; LSDV-P (5 пмоль) – 0,5 мкл; dNTPs (10 пмоль каждого) – 0,5 мкл; Taq-полимераза – 0,25 ед.; ДНК-образец – 5,0 мкл; деионизированная вода – до 25 мкл. Программа амплификации: 95°C – 3 мин; 45 циклов: 95°C – 10 с, 55°C – 20 с (регистрация флуоресценции по каналу ROX), 72°C – 15 с. Пороговый цикл (Ct) считали положительным при Ct?38. Контрольные образцы: отрицательный контроль (деионизированная вода); внутренний контроль (фаголизат бактериофага Т4, 5?10? фаговых частиц/мкл, детекция по каналу FAM); положительный контроль (рекомбинантная плазмидная ДНК pLSDV-187 в смеси с плазмидой, содержащей фрагмент ДНК фага Т4, концентрация 1?104 копий/мкл). Выделение вируса проводили на культуре клеток почки эмбриона овцы (ПЭО) согласно [15]. Результат оценивали по цитопа-тическому эффекту (ЦПЭ) на 5-7 сутки. Статистический анализ проведен с использованием программ GraphPad Prism 9.5 (GraphPad Software, США) и MS Excel 2019. Диагностическую чувствительность (Se) и специфичность (Sp) рассчитывали по стандартным формулам. Предел обнаружения (LoD) определяли методом серийных 10-кратных разведений плазмидной ДНК. Воспроизводимость оценивали по коэффициенту вариации (CV, %) значений Ct при 5-кратном повторении. Результаты исследований и их обсуждение. Сравнительная характеристика методов. Аналитическая чувствительность и специфичность разработанной ПЦР-РВ. Предел обнаружения разработанной тест-системы составил 10? копий ДНК LSDV/мкл, что сопоставимо с лучшими коммерческими аналогами. Аналитическая специфичность подтверждена отсутствием перекрестной амплификации при тестировании панели из 42 проб, содержащих ДНК гетерологичных вирусов (вирус оспы овец, вирус оспы коз, герпесвирус крупного рогатого скота 1-го типа, вирус парагриппа-3, вирус лейкоза крупного рогатого скота). Диагностическая эффективность на клиническом материале. При исследовании 286 проб патологического материала разработанной ПЦР-РВ тест-системой получены следующие результаты: положительные – 84 пробы, отрицательные – 202 пробы. Диагностическая чувствительность составила 99,2% (95% ДИ 97,5-100), диагностическая специфичность – 99,5% (95% ДИ 98,1-100). Результаты сравнительной оценки методов представлены в таблице 2. Таблица 2 Сравнительная оценка диагностической эффективности методов выявления вируса заразного узелкового дерматита (n=286)
Примечание: за «истинный» статус принимали положительный результат хотя бы в двух методах. Коэффициент вариации значений Ct при пятикратном повторении для высокой (106 копий/мкл), средней (103 копий/мкл) и низкой (10? копий/мкл) концентраций ДНК не превышал 3,5%, что свидетельствует о высокой воспроизводимости разработанной тест-системы. Концентрация 5?103 соответствует предельному обнаружению в 95% повторений. Проведенный сравнительный анализ показал, что иммуно-хроматографический метод (патент № 2648773) обладает неоспоримым преимуществом в оперативности (10-15 минут) и простоте выполнения, что делает его незаменимым для массового скрининга поголовья непосредственно в хозяйстве, на пунктах пропуска через границу или в условиях полевых ветеринарных отрядов [12]. Однако чувствительность ИХА (85,7% по нашим данным) не позволяет выявлять животных с низкой вирусной нагрузкой – в частности, на ранней стадии инфекции или при латентном носительстве. Аналогичные результаты получены зарубежными исследователями: чувствительность коммерческих ИХА-тестов для LSDV варьирует от 79% до 90% [16]. Разработанная нами ПЦР-РВ тест-система (таргетирование гена GPCR) продемонстрировала высокие диагностические характеристики (чувствительность 99,2%, специфичность 99,5%), превосходя как ИХА, так и классическую ПЦР с электрофоретической детекцией. Полученные результаты согласуются с данными других исследователей [13, 14, 17, 18]. Применение внутреннего контрольного образца (фаг Т4) позволяет исключить ложноотрицательные результаты, связанные с наличием ингибиторов ПЦР в биологическом материале. Выбор гена GPCR в качестве мишени для ПЦР-РВ имеет дополнительное преимущество: вариабельный участок данного гена позволяет в перспективе дифференцировать полевые изо-ляты LSDV от вакцинных штаммов, что особенно актуально в условиях массовой вакцинации [13, 18]. В работах Bhakha и соавт. (2025) показана возможность использования HRM-анализа по гену GPCR для дифференциации дикого типа, азиатских рекомбинантных и вакцинных штаммов [13]. Заключение. Проведенный анализ показывает, что рассматриваемые методы диагностики не являются конкурентными, а органично дополняют друг друга. Для повышения эффективности проти-воэпизоотических мероприятий в условиях Российской Федерации рекомендуется внедрение двухэтапной системы диагностики: – первый этап (скрининг) – использование иммунохрома-тографических тест-полосок (патент № 2648773) для быстрого выявления подозрительных животных на фермах, в стадах и на пунктах пропуска через границу. Метод позволяет в течение 1015 минут принять первичное решение об изоляции животного; – второй этап (верификация) – обязательное подтверждение положительных и сомнительных результатов методом ПЦР в реальном времени (разработанная тест-система на основе гена GPCR, а также патент № 2726242) в референтных лабораториях. Это позволяет минимизировать риски распространения инфекции, выявлять вирусоносителей на ранних стадиях и избегать экономических потерь от необоснованного введения ограничительных мер. Разработанная ПЦР-РВ тест-система обеспечивает предел обнаружения 10? копий ДНК/мкл, высокую воспроизводимость (CV?3,5%) и диагностическую эффективность 99,2-99,5%, что соответствует современным мировым стандартам и может быть рекомендована для внедрения в практику ветеринарных лабораторий Российской Федерации. Список литературы: 1. Кононов А. В. [и др.]. Выявление генома вируса заразного узелкового дерматита (нодулярного дерматита) КРС в полевых образцах от КРС на территории Российской Федерации. Ветеринария сегодня. 2018; (1): 29-32. 2. Мищенко А. В. [и др.]. Экологические особенности нодулярного дерматита крупного рогатого скота. Ветеринария Кубани. 2017; (5): 3-7. 3. Кононов А. В. Заразный узелковый дерматит крупного рогатого скота в Российской Федерации в 2015-2020 годах: особенности эпизоотологии, разработка и осуществление противоэпизоотических мероприятий. Казань. 2022: 35 с. 4. Мищенко В. А. [и др.]. Проблема нодулярного дерматита крупного рогатого скота. Ветеринария Кубани. 2015; (5): 3-6. 5. Спрыгин А. В. Заразный узелковый дерматит КРС: генодинамика и изучение потенциальных переносчиков на территории Российской Федерации. Владимир. 2021: 41 с. 6. Шевченко А. А. [и др.]. Эпизоотическая ситуация, симптомы и профилактика нодулярного дерматита в Краснодарском крае. Труды Кубанского государственного аграрного университета. 2019; (76): 194-198. 7. Кривонос Р. А. [и др.]. Болезни крупного рогатого скота, проявляющиеся везикулярными поражениями. Ветеринария Кубани. 2023; (6): 3-7. 8. Vatsaev S. V. et al. Peculiarities of pathogenetic mechanisms of ‘parasite-host’ system functioning in case of cattle affection by nodular dermatitis. Annals of Agri Bio Research. 2019; (24 (1): 129-133. 9. Tuppurainen E. S. M., Oura C. A. L. Review of Capripoxvirus diseases: Overview of current situation in Africa and the Middle East. Transboundary and Emerging Diseases. 2018; (65 (6): 1481-1491. 10. Спрыгин А. В. [и др.]. Тест-системы ПЦР для выявления генома каприпоксвирусов и вируса заразного узелкового дерматита. Сельскохозяйственная биология. 2019; (54 (2): 347-458. 11. Bhat B.A. et al. Recent advances in techniques used in the diagnosis of lumpy skin disease: a review. Journal of Veterinary Diagnostic Investigation. 2025; (37 (6): 845-853. 12. Черных О. Ю. [и др.]. Способ экспресс-диагностики нодулярного дерматита КРС. Патент № 2648773. Российская Федерация. МПК G01N 33/533: № 2016132731/13, заявл. 08.08.2016: опубл. 28.03.2018. Бюл. № 10 : заявитель и патентообладатель Кубанский ГАУ. 7 с. 13. Bhakha K. et al. Development of a Multi-Locus Real-Time PCR with a High-Resolution Melting Assay to Differentiate Wild-Type, Asian Recombinant, and Vaccine Strains of Lumpy Skin Disease Virus. Veterinary Sciences. 2025; (12 (3): 213. 14. Roy S. et al. Characterization of Lumpy Skin Disease in Northern Bangladesh: Clinical, Pathological, Biochemical, and Molecular Perspectives. Vet Med Int. 2025: 4623554. 15. Tran H. T. T. et al. A new variant of lumpy skin disease virus circulating in Vietnam based on sequencing analysis of GPCR gene. Open Veterinary Journal. 2024; (14 (7): 1701-1707. 16. Банов В. А. [и др.]. Тест-система для выявления ДНК вируса нодулярного дерматита (LSDV) в биологическом материале животных с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени. Патент № 2726242. Российская Федерация. МПК С12Q 1/68 : № 2019133068, заявл. 16.10.2019 : опубл. 10.07.2020. Бюл. № 20 : заявитель и патентообладатель Кубанский ГАУ. 8 с. 17. Sprygin A. et al. Epidemiological characterization of lumpy skin disease outbreaks in Russia in 2016. Transboundary and Emerging Diseases. 2018; (65 (6): 1514-1521. 18. Manic M. et al. Epizootic features and control measures for lumpy skin disease in south-east Serbia in 2016. Transboundary and Emerging Diseases. 2019; (66 (5): 2087-2099. 19. Chichkin A. N. et al. The study of insects of the order Diptera for the presence of the genetic material of the lumpy skin disease virus by a polymerase chain reaction. Veterinary Medicine. 2020; (23 (7): 24-31. Сведения об авторах: Шевченко Александр Алексеевич, доктор ветеринарных наук, профессор, заведующий кафедрой микробиологии, эпизоотологии и вирусологии ФГБОУ ВО «Кубанский государственный аграрный университет имени И. Т. Трубилина»; 350044, Россия, г. Краснодар, ул. Калинина, 13; тел.: 8-918-1549461; e-mail: shevshenkoalexandr@yandex.ru. Коновалов Михаил Геннадьевич, старший преподаватель кафедры микробиологии, эпизоотологии и вирусологии ФГБОУ ВО «Кубанский государственный аграрный университет имени И. Т. Трубилина»; 350044, г. Краснодар, ул. Калинина, 13; тел.: 8-989-8226274; e-mail: meshakonovalov@yandex.ru. Кривонос Роман Анатольевич, доктор ветеринарных наук, руководитель департамента ветеринарии Краснодарского края, доцент, научный сотрудник ФГБНУ ФНЦ ВИЭВ РАН; 350000, г. Краснодар, ул. Рашпилев-ская, 36; e-mail: uv@krasnodar.ru. Ответственный за переписку с редакцией: Черных Олег Юрьевич, доктор ветеринарных наук, профессор, директор ГБУ КК «Кропоткинская краевая ветеринарная лаборатория», главный научный сотрудник ФГБНУ ФНЦ ВИЭВ РАН; 352391, Краснодарский край, Кавказский район, г. Кропоткин, ул. Красноармейская, 303; e-mail: gukkvi50@kubanvet.ru. Заявленный вклад авторов: Шевченко А. А.: разработка концепции, научное руководство, написание рукописи – редактирование. Коновалов М. Г.: проведение исследования, формальный анализ, визуализация, написание черновика рукописи. Кривонос Р. А.: курирование данных, валидация результатов, написание рукописи – рецензирование и редактирование. Черных О. Ю.: разработка методологии, предоставление ресурсов, написание рукописи – редактирование. Конфликт интересов: авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов. |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||